上一篇讲了Geatpy的库函数和数据结构
熟悉了之后,我尝试编写一个编程模板解决一个约束优化问题:
在这个问题里,我们很容易知道目标函数的最小值为0,而这是个目标函数最大化问题,因此,我们可以对不符合约束条件的解的目标函数值设为0。而且不需要写罚函数了,直接把约束条件写在目标函数接口文件里即可。
编写目标函数接口文件:
下面一步步来编写编程模板,以解决这个约束优化问题。
编写编程模板时一个要注意的地方是:调用目标函数时,传入的参数必须和目标函数的参数列表一致。
我们试一下一种改进的遗传算法,即不用遗传算法的经典流程,而是在进化过程中,先对父代进行交叉和变异产生子代,然后父代和子代直接合并成一个大的种群,再从这个大的种群中挑选50%的优秀个体存活下来。在下一次进化迭代中,这50%的个体继续沿用上面的流程进行交叉、变异、选择。
这种改进遗传算法的好处是具有很强的精英保留能力。可以使算法快速收敛,得到最优结果。
为了使模板函数能够用于更多的场景,能同时解决整数型和实数型控制变量的问题。于是编写编程模板如下:
""" templet.py """# -*- coding: utf-8 -*-import numpy as npimport geatpy as gaimport time"""输入参数: AIM_M - 目标函数的地址,传入该函数前通常由AIM_M = __import__('目标函数名')语句得到 AIM_F : str - 目标函数名 PUN_M - 罚函数的地址,传入该函数前通常由PUN_M = __import__('罚函数名')语句得到 PUN_F : str - 罚函数名 FieldDR : array - 实际值种群区域描述器 [lb; (float) 指明每个变量使用的下界 ub] (float) 指明每个变量使用的上界 注:不需要考虑是否包含变量的边界值。在crtfld中已经将是否包含边界值进行了处理 本函数生成的矩阵的元素值在FieldDR的[下界, 上界)之间 problem : str - 表明是整数问题还是实数问题,'I'表示是整数问题,'R'表示是实数问题 maxormin int - 最小最大化标记,1表示目标函数最小化;-1表示目标函数最大化 MAXGEN : int - 最大遗传代数 NIND : int - 种群规模,即种群中包含多少个个体 SUBPOP : int - 子种群数量,即对一个种群划分多少个子种群 GGAP : float - 代沟,本模板中该参数为无用参数,仅为了兼容同类的其他模板而设 selectStyle : str - 指代所采用的低级选择算子的名称,如'rws'(轮盘赌选择算子) recombinStyle: str - 指代所采用的低级重组算子的名称,如'xovsp'(单点交叉) recopt : float - 交叉概率 pm : float - 重组概率输出参数: pop_trace : array - 种群进化记录器(进化追踪器), 第0列记录着各代种群最优个体的目标函数值 第1列记录着各代种群的适应度均值 第2列记录着各代种群最优个体的适应度值 var_trace : array - 变量记录器,记录着各代种群最优个体的变量值,每一列对应一个控制变量 times : float - 进化所用时间"""def templet(AIM_M, AIM_F, PUN_M, PUN_F, FieldDR, problem, maxormin, MAXGEN, NIND, SUBPOP, GGAP, selectStyle, recombinStyle, recopt, pm): """==========================初始化配置===========================""" GGAP = 0.5 # 因为父子合并后选择50%的个体留到下一代,因此要将代沟设为0.5以维持种群规模 # 获取目标函数和罚函数 aimfuc = getattr(AIM_M, AIM_F) # 获得目标函数 if PUN_F is not None: punishing = getattr(PUN_M, PUN_F) # 获得罚函数 NVAR = FieldDR.shape[1] # 得到控制变量的个数 # 定义进化记录器,初始值为nan pop_trace = (np.zeros((MAXGEN ,2)) * np.nan) # 定义变量记录器,记录控制变量值,初始值为nan var_trace = (np.zeros((MAXGEN ,NVAR)) * np.nan) """=========================开始遗传算法进化=======================""" if problem == 'R': Chrom = ga.crtrp(NIND, FieldDR) # 生成初始种群 elif problem == 'I': Chrom = ga.crtip(NIND, FieldDR) start_time = time.time() # 开始计时 # 开始进化!! for gen in range(MAXGEN): # 进行遗传算子,生成子代 SelCh=ga.recombin(recombinStyle, Chrom, recopt, SUBPOP) # 重组 if problem == 'R': # 若是实数型控制变量,则用mutbga进行变异 SelCh=ga.mutbga(SelCh,FieldDR, pm) # 变异 elif problem == 'I': # 若是整数型控制变量,则用mutint进行变异 SelCh=ga.mutint(SelCh, FieldDR, pm) Chrom = np.vstack([Chrom, SelCh]) # 父子合并 ObjV = aimfuc(Chrom) # 求后代的目标函数值 pop_trace[gen,0] = np.sum(ObjV) / ObjV.shape[0] # 记录种群个体平均目标函数值 if maxormin == 1: pop_trace[gen,1] = np.min(ObjV) # 记录当代目标函数的最优值 var_trace[gen,:] = Chrom[np.argmin(ObjV), :] # 记录当代最优的控制变量值 elif maxormin == -1: pop_trace[gen,1] = np.max(ObjV) var_trace[gen,:] = Chrom[np.argmax(ObjV), :] # 记录当代最优的控制变量值 # 最后对合并的种群进行适应度评价并选出一半个体留到下一代 FitnV = ga.ranking(maxormin * ObjV, None, SUBPOP) if PUN_F is not None: FitnV = punishing(Chrom, FitnV) # 调用罚函数 Chrom=ga.selecting(selectStyle, Chrom, FitnV, GGAP, SUBPOP) # 选择 end_time = time.time() # 结束计时 # 绘图 ga.trcplot(pop_trace, [['种群个体平均目标函数值', '种群最优个体目标函数值']]) if maxormin == 1: best_gen = np.argmin(pop_trace[:, 1]) # 记录最优种群是在哪一代 print('最优的目标函数值为:'+ str(np.min(pop_trace[:, 1]))) elif maxormin == -1: best_gen = np.argmax(pop_trace[:, 1]) # 记录最优种群是在哪一代 print('最优的目标函数值为:' + str(np.max(pop_trace[:, 1]))) print('最优的控制变量值为:') for i in range(NVAR): print(var_trace[best_gen, i]) print('最优的一代是第' + str(best_gen + 1) + '代') times = end_time - start_time print('时间已过'+ str(times) + '秒') # 返回进化记录器、变量记录器以及执行时间 return [pop_trace, var_trace, times]
好了,现在该编程模板可以用于解决这类约束优化问题了。控制变量既可以是整数,也可以是实数。
下面编写执行脚本:
因为这道题的控制变量x1和x2的区间都是单侧的,因此我们设个大一点的区间以便搜索最优解。我们采用锦标赛选择算子,并设置最大进化代数为100,种群规模为100,使用两点交叉,交叉和变异概率分别是0.9和0.1。
运行结果如下:
最优的目标函数值为:39.0
最优的控制变量值为:
3.0
3.0
最优的一代是第40代
时间已过0.11623454093933105秒
至此,我们知道了如何自定义编程模板实现遗传算法了。在Geatpy中,内置了好几种进化算法编程模板。详细源码可以参见
使用Geatpy内置模板会使上面的例子变得更加简单,只需编写目标函数接口和执行脚本就可以了。比如上面的例子,使用Geatpy框架,真正只需几行代码便可以解决:
在后面的版本中,Geatpy将不断丰富和改进编程模板,以Geatpy的算法性能。比如添加MOEA/D多目标优化编程模板等。有相关想法的也可以email:jazzbin@geatpy.com。
更多教程可以参见官网 (repairing),以及参见Geatpy的源码和demo示例: 你将有更多的收获。
在下一篇,我们将讲述如何使用Geatpy解决一些实际的有趣问题。
欢迎继续跟进,谢谢大家!